Essa pergunta é feita por muitos e geralmente é respondida de acordo com gosto pessoal, um forte erro!

Basear qual linguagem ou qual formato seu site irá usar, através do seu gosto pessoal é voltar no tempo e esquecer a nova realidade da personalização para seu público alvo.

Entender o novo comportamento web, adequar as necessidades atuais e onde queremos chegar com um projeto web são perguntas que levarão a uma resposta mais racional e adequada!

A grade questão geralmente gira em torno, faço meu site em FLASH ou HTML?

Os dois formatos são ótimos e ambos tem altos e baixos! Veremos vantagens e desvantagens de cada um:

Vantagens de desenvolver seu site em formato Flash:

1. Grande interação com usuário
2. Elementos móveis
3. Possibilidade de forte apelo através de música, vídeos, 3D
4. Ótimos para campanhas pontuais e hot-sites

Desvantagens de desenvolver seu site em formato Flash:

1. Demora no carregamento da página
2. Necessita um plugin para rodar
3. O site pode apresentar problemas de acordo com a configuração do micro do usuário
4. Não indexação nos buscadores, como Google
5. Caso opte em fazer uma campanha de links patrocinados, você pagará mais caro na campanha
6. Complica a divulgação de links do site através de midias sociais, como Bookmarks.

Vantagens de desenvolver seu site em formato HTML:

1. Site leve e roda em qualquer máquina
2. Ótima velocidade de carregamento
3. TODOS os mecanismos de pesquisa são capazes de ler e exibir seu site
4. Integração TOTAL com sistemas e websites atuais

Desvantagens de desenvolver seu site em formato HTML:

1. Não é possível ter um grande apelo através de músicas, objetos 3D e animações

Vamos ver algumas aplicações:

• Site Tecnisa
  • Existe uma preocupação clara com indexação e por isso a Tecnisa utiliza em grande parte do seu site HTML puro.
  • Conheça o principal site da Tecnisa: http://www.tecnisa.com.br/
  • Conheça um hot-site do Summer Family Resort: http://www.tecnisa.com.br/imovel-residencial-apartamento-vila+mascote-sao+paulo-summer.html
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• Site Chevrolet
  • É desenvolvido com uma mistura entre HTML + Detalhes em Flash.
  • Quando o visitante quer obter mais informações sobre determinado veículo, onde é necessário impactar e usar recursos não disponíveis no HTML ele é direcionado para um hot-site.
  • Conheça o site principal da GM: http://www.chevrolet.com.br/action/home?cntryCd=BR
  • Veja o hot-site do Celta, desenvolvido em FLASH: http://www.chevrolet.com.br/content_data/LAAM/BR/pt/GBPBR/001/html/chevy_portal/carhome/celta/main.html
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• Site Som Livre
  • Ótima relação conteúdo, navegação inteligente e HTML puro.
  • O Projeto Slap que visa divulgar e integrar os novos talentos da música brasileira, tem uma solução legal para os artistas e cria um hot-site muito interessante com interações via Youtube, Flickr, Comentários, etc.
  • Veja o site da Som Livre: http://www.somlivre.com/
  •  Conheça o  Slap: http://www.slap.mus.br/?/
  • Conheça o hot-site do Tiago Iorc: http://www.slap.mus.br/?11320/artista/Tiago-Iorc
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Conclusão:

Seu projeto pode impactar de diversas formas, utilizando os mais variados recursos existentes na web. Jamais use gosto pessoal em um projeto! Esqueça EGO! Estude o que seu público está consumindo e desejando no momento.

Projetos desenvolvidos em HTML puro tendem a indexar mais no Google, ter uma penetração maior, mais velocidade de carregamento, conseguir melhores métricas e também um interação maior com todos sistemas web.

Projetos desenvolvidos em FLASH terão um público mais fechado (necessita de conexão e máquina mais robusta), jamais será indexado pelos buscadores, será sempre indicado para hot-sites e campanhas pontuais (período para terminar).